可惜……当众人来到三座湖泊时，洞穴的入口依旧关闭着……
可恶……
小智，接下来怎么办……
小智，可能没有时间了……
天冠山上的天空开始扭曲，扭曲的虫洞伴随着电闪雷鸣的云层，似乎是有什么东西想钻出来的样子……
时间……再多一点就好了……
小智！
凤王，你怎么也跑出来了？！
诶诶诶—？！
情况很紧急，我只好当面出来说了！
幻影小智正在创世神祭坛面前进行着远古仪式，好像是想召唤什么东西出来，只不过他没有基因之楔，目前还不能进行仪式
那我现在就去阻止他！
不行，如果基因之楔被夺走就完了！
就是因为这样，才要去阻止他，这样躲着迟早有一天会被夺走，那就正面迎战他！
小智拿出基因之楔递给小光
诶？！
皮卡丘，凤王，梦幻，保护好小光，我去争取时间！
胡帕召唤光圈将小智传送走了
等等小智！
小智！
这家伙……
天冠山上
小智，真的要去吗……
胡帕感应到了山上很危险……
这样的话也要去！
小智开始在新修的楼梯上奔跑着，没过多久就来了宝可梦阻挡…
mega班基拉斯吼！
切……
胡帕，保存体力，我们绕过他！
嗯！
小智躲过了班基拉斯的破坏光线，在胡帕的辅助下躲过了从班基拉斯的身旁跑了过去，没过多久，山顶飞下来幻影mega暴飞龙再次拦住了小智的去路
mega暴飞龙吼！
后面的班基拉斯也追上来阻挡了退路
切……只能应战了吗……
小智刚想召唤精灵出来对战，一只幻影勇士雄鹰废了出来使用空气斩打在了小智的脚边
勇士雄鹰鹰！
三方包夹吗……
小智……
正当小智一筹莫展时，一发破坏光线打在了勇士雄鹰的身上，一发波导弹和一发暗影球打在班基拉斯和暴飞龙身上
看来你需要帮忙呢小智
巨金！
久等了小智
沙奈！
小智，没事吧？
路卡！
诶，你们三位怎么会在这里？
希罗娜小姐通知我们来的，没想到刚过来就碰上这种事
你不是要登顶阻止他吗？还愣着干什么？
是啊，这里交给我们！
大家……这份恩情我一定会回报的！
小智和胡帕绕过暴飞龙开始向山顶上奔去……
艾岚这边，全速前进的空中堡垒终于靠近了天冠山附近
按照小智的个性，他应该已经上去了，我们快找地降落吧！
不，看那边！
喷火龙（幻影）吼～！
切……幻影喷火龙吗……
诶，那只喷火龙好像比之前的还要巨大诶？！
不行，这样的话会被击落的，艾岚，我记得有路上到飞船上面吧！就在那里把它打下来！
嗯，那拜托你们了！
除了艾岚，众人来到了飞船上面的平台派出了各自的宝可梦迎战巨型幻影喷火龙。小智则是来到了距山顶的3/4处的一处休息亭，再次被宝可梦阻挡下来
烈焰猴（幻影）me gei！
捷拉奥拉（幻影）吼！
不妙啊……
此时一发闪电和紫色的光线打过来击退了两只宝可梦
吼～！
奥拉！
时间刚刚好啊…
还好吧，小子
迪亚先生和夏卡先生？！
小智！
没事吧？
诶？卡侬和拉帝欧斯也来了？
事不宜迟，你们赶快上去吧！
我请求了援助，应该快到了
走吧，小智。拉帝欧斯，拜托你了！
交给我吧！
卡侬把小智拉到拉帝欧斯背上，直接飞向了山顶，夏卡先生和迪亚先生则留下来对付两只宝可梦
黯影小智看来……主角终于来了啊……
卡侬，等会儿在我后面好好待着啊
诶？好……好……
喂，给我适可而止了！
甲贺忍蛙（幻影）ko…ga……
黯影小智这次，我亲自来对付他……
甲贺忍蛙（幻影）ko…ga…（好）
黯影小智呐，小智，我们还没有真正对战过吧…
嗯？
黯影小智你没发现，之前都是甲贺忍蛙自己在战斗吗？我可是没有怎么指挥，也就使用特技的时候我才会指挥
难道说……
黯影小智丢出精灵球，召唤出了“甲贺忍蛙”
黯影甲贺忍蛙ko…ga…
“甲贺忍蛙”刚出来就展现了强大的压迫感，背后冒着紫火，全身程紫色伴有黑色的点缀，上场就直接是羁绊形态
黯影小智来吧，让我们来一场真正的战斗吧！黄金甲贺忍蛙！
黯影小智这是仪式的一部分！
仪式？你的目的到底是什么！
黯影小智目的？现在告诉你也无妨……
黯影小智我的目的就是成为你！
成为我？！
黯影小智是的，我作为你的影子，每天都只能活在你的阳光找不到的阴影下，为什么我们做影子的是能这样活着？明明我也是“小智”！
什……
黯影小智水手里剑！
黯影甲贺忍蛙ko…ga……！
小智！
甲贺忍蛙展开羁绊形态从手表里飞出来挡下了攻击
黯影小智终于肯出来了啊，甲贺忍蛙！
等等，你说你的目的是为了成为我对吧？
黯影小智对！我们一直共用着这具身体，我一直以来的目的就是为了击败你，成为你，只要仪式成功，我可以占据你的身体，成为你！让你也尝尝活在影子里的感觉！
黯影小智水手里剑！
黯影甲贺忍蛙ko ga！
水手里剑回击！
ko ga！
紫色的水手里剑明显比蓝色的水手里剑强力，蓝色的手里剑直接被避开，甲贺忍蛙迅速反应过来，一个后空翻躲过了攻击。
居然能……
小智…
甲贺忍蛙（幻影）ko…ga……（别碍事……）
幻影甲贺忍蛙直接闪现到卡侬眼前，卡侬吓得退了几步，幻影忍蛙直接将地面劈开一刀裂痕，警告她们不要往前。
卡侬，没事吧？
诶，我没事…
黯影小智关心别人是好的，可惜战斗的时候不要东张西望！
黯影忍蛙直接冲到忍蛙面前，刀刃砍在腹部，忍蛙被直接击飞了出去，爬起来后回了两个手里剑。黯影忍蛙旋转身子砍爆了手里，忍蛙从烟雾中窜出，丢出巨大的手里剑。手里剑击中了黯影忍蛙，顺便硬接下了忍蛙的劈砍。
黄金拔刀斩！
ko ga！（吃爷一击！）
黯影小智五芒星•剑斩！
黯影忍蛙分出五个分身，挥砍出的剑气汇聚成五芒星和黄金拔刀斩的剑气对撞在一起，双方不分伯仲，两个技能在中间发生了爆炸，双方都被炸飞了出去。
咳咳，没事吧，甲贺忍蛙……
ko…（没事…）
甲贺忍蛙（幻影）ko…（没事吧…）
黯影小智嗯……
幻影忍蛙即使使用了水手里剑挡下了冲击，黯影小智没有受到多大伤害。
小智，没事吧…
放心，死不了
小智顺手摸了一下卡侬的后脑勺
黯影小智好了，该进行第二场了……
等等！
黯影小智…？
你的目的，真的只是为了成为我吗？
黯影小智不然呢？
我觉得，你的目的并非是这样的……
甲贺忍蛙（幻影）是的……
黯影小智嗯？你说话了？！
嗯？
诶？
幻影忍蛙挡下冲击后走到了“小智”后面。现在，它用自己的声音回应了小智的问题，众人被他给吓了一跳，连黯影小智都没反应过来就被幻影忍蛙的黑暗给束缚住了。
所以，现在是什么情况？
额……我也有点搞不懂……
甲贺忍蛙（幻影）咱们，先看看远处的天空，在了进入正题吧……
众人将眼神望向远处，远处的巨型喷火龙喷出紫色的火焰击中了飞船的发动机，失去动力的飞船直接直线下坠。小智在这里看到了在飞船顶部的众人，即将随飞船坠落了到地面……
你！
甲贺忍蛙（幻影）你现在的处境可是很危险的……
幻影忍蛙将黯影小智和黯影忍蛙退下祭坛的台阶，他们在地上滚了几圈最终停了下来，可是还是被束缚着。
喂！你到底想怎样？！
没事吧！
小智跑过来查看了“小智”小智的伤势，结果黯影小智根本不领情。
我还轮不到你来关心！
……
甲贺忍蛙（幻影）来吧，小智，让我来跟你再次的对决吧……
幻影喷火龙从天而降，幻影烈焰猴从后方直接跳到了幻影忍蛙的身边，三只宝可梦并排站在上面俯视着众人，迪亚先生和夏卡先生也带着自己的宝可梦追了上来结果直接被紫色的墙阻挡了起来。
小子，还好吧？
啊，我还好…
情况有点糟糕啊……
甲贺忍蛙（幻影）来吧，让我们进入最后一个环节吧…
幻影忍蛙拿出基因之楔将它放到了祭坛的一处凹槽里
基因之楔？！
甲贺忍蛙（幻影）哈哈，其实，一开始基因之楔就被我拿走了，你们带在身上的只不过是个垃圾而已，为了防止暴露，我还专门演了戏，真是累死我了
甲贺忍蛙（幻影）那么，万事具备了呢…
幻影忍蛙举起双手，身边的喷火龙和烈焰猴化作黑雾在幻影忍蛙的两手中间聚集，蓝黑相间的石头和冰柱石板，基因之楔发光，射出一道光束到黑雾中，最后创世神刻印样式的吊坠发光，散发出黄色的粒子被黑雾吸收，黑雾随即笼罩了幻影忍蛙，最终，一个长有喷火龙翅膀和尾巴的甲贺忍蛙随着黑雾显现在众人面前。
邪恶忍蛙啊……终于又再次面对你了呢……甲贺忍蛙……
睿智湖
诶？这个基因之楔怎么发起光了？
这个的意思…难道说！
小光手中基因之楔瞬间变成沙子散落在地上，三人这才明白原来所有的东西早就被夺走了…
不妙啊……
诶，那个是不是空中堡垒啊？好像掉下来了诶？！
得赶紧过去帮忙！
正当凤王刚想飞过去的时候，一阵强光闪过，三人来到了天冠山楼梯口，一同到来的还有迪亚先生和夏卡先生，卡侬，大吾先生，卡露乃小姐，可尔妮以及在另外两座湖泊的伙伴。众人被突如其来的传送弄晕了脑子，但反应过来后第一时间救助了空中堡垒的众人，好在是没有什么人受重伤。
那个，小光，小智呢？
对啊，这个时候不应该第一个看到他冲过来吗？
诶？我以为那家伙也被传送下来了？
这句话的意思就是……
小智还在上面咯？！
众人反应了过来，刚想爬上楼梯就被紫色的墙挡住，无论众人怎样拍打都纹丝不动。众人拍打的时候，墙面显现出画面，正是小智与“甲贺忍蛙”的对峙画面……
山上
邪恶忍蛙来吧，让我来解释这一切吧……
你对我的朋友做了什么？！
邪恶忍蛙也没什么，就是把他们传送到了山下让他们看看这场毫无胜算的战斗。
切……
邪恶忍蛙我做的一切都是为了击败你！甲贺忍蛙！
ko？
邪恶忍蛙之前被你封印的一切，我都要讨回来！
等，等，等一下！
什么封印什么的，这是什么意思？
邪恶忍蛙很早以前，光明和黑暗，幻影并为三大势力，可是光明为了它所谓的正义，将幻影封印到了自己的身后，被光明所笼罩……
邪恶忍蛙从那之后，光明就和黑暗成为两边对峙的局面，而我们幻影就被永远的隐藏了起来……我做这些，就是为了证明，幻影比光明强大，所以，我要击败你，拥有圣光之力的甲贺忍蛙和拥有波导之力的小智…
所以我只是你的一个棋子对吧！
ko ga！
邪恶忍蛙是的，终于发现了啊，谢谢你帮我集齐所有的物品…
邪恶忍蛙现在，你们两个可以商量一下怎么击败我……
邪恶忍蛙不过，可没有这么容易哦……
“甲贺忍蛙”后面的天空开始出现扭曲，过了一会儿，时空三龙和酋雷姆，哲尔尼亚斯，伊裴尔塔尔从扭曲的空间中降临，达克莱伊也从后方的黑雾中显现出来。几只巨型的神兽开始俯瞰小智等人，眼中的红色代表着他们被控制了心智……
时空三龙又双叒叕被控制了心智
邪恶忍蛙不好意思，这场战斗就像我刚才说的，毫无胜算……
小智……
小智，怎么办……
事到如今……
小智放出了代欧奇希斯，拉帝欧斯也进行了mega进化
邪恶忍蛙吼，放手一搏吗？也好，让你们俩死在一起
邪恶忍蛙解开了黯影小智和黯影忍蛙的束缚
邪恶忍蛙不过你不放出其他的宝可梦吗？
只要能击败你，这几只宝可梦足以，不需要其他的宝可梦！
邪恶忍蛙吼，我到要看看你的能耐！
拉帝欧斯，胡帕，代欧奇希斯，帮我拖住那几只神兽！
一起战斗吧！“小智”
虽然不想跟你一起战斗，但是，欺骗我的感情，我不会原谅的，先说好，干掉他之后我们还是敌人！
好好好
邪恶忍蛙吼，同盟了啊也好，方便我一次性干掉你们两个人。
两只甲贺忍蛙起身丢出两发手里剑，邪恶忍蛙也丢出两发手里剑，四发手里剑对掉后，三只宝可梦开始了混战。
居合斩！
暗袭要害！
小智的忍蛙打头阵，刀刃被挡下，黯影忍蛙闪现到邪恶忍蛙的背后，刚想偷袭却被尾巴击飞，甲贺忍蛙也被一脚踹飞。
天上的神兽和幻兽也在混战，3只宝可梦终究是不敌7宝可梦，三只宝可梦还是败下阵来…
拉帝欧斯！胡帕！代欧奇希斯！
果然还是不敌一级神啊……
咳咳……
胡帕尽力了……
邪恶忍蛙喂，战斗时可不要分心哦！
邪恶忍蛙丢出手里剑炸飞了小智
咳咳……
喂，行不行啊？
咳咳…抱歉……
切……
水手里剑！
ko ga！
邪恶忍蛙不好意思，我单方面宣布你死了……
什么？！
邪恶忍蛙拔出刀刃一击封喉了黯影甲贺忍蛙，直接一刀刃插进了黯影小智的身体里……
邪恶忍蛙不好意思了……
什…？！
抱歉呐……
黯影小智倒在地上，小智爬了起来飞奔到他的身边，明明是敌人，下面的众人看到这一幕也是触目惊心。
喂，喂，你不是要成为我吗？怎么现在就倒下了？！
我没有倒下，只是再次回到你的身体而已…咳咳…是时候让你拿回所有的力量了，我的存在让你无法使用圣光形态…抱歉呐…
黯影小智和黯影忍蛙开始慢慢消散成粒子
放心，我们会再见的……
最终消散的粒子被小智和甲贺忍蛙吸收…
可恶啊！
邪恶忍蛙怎么，想一个人打败我们所有人吗？
不试试怎么知道呢？！
小智！
妹妹，你怎么上来了？！
偷偷跑上来的…
但也没有白来，咱们带来了支援！
在凤王飞上来的瞬间，黑白双龙待着N先生来到了塔顶
哟，小智，看起来你要帮忙啊
N伸出了手将小智拉了起来
你怎么……
小智！
古老的歌声响起，众人的伤势瞬间被治疗，一只宝可梦降落到了小智的肩上。
美洛耶塔？！
夏卡先生找到了这家伙，但她不跟夏卡先生走，于是他拜托我把她带过来
当然，来的不只有他…
小智，我让我在帮你一次吧
小智！
吾也前来助阵了！
天空出现巨大的绿色的Z字，基格尔德降临于世
来吧！
好久不见了，小智
小智，小智，我也来了！
一同前来的还有雷吉奇卡斯以及三圣柱
大家……
哟哟，流泪了啊
感动的话等会儿再说吧
嗯！
邪恶忍蛙局势逆转了啊……
邪恶忍蛙不过，你们没有任何胜算的！
甲贺忍蛙！
哦，差点忘了，还有胡帕
胡帕！
准备战斗！
ko ga！
甲贺忍蛙变成圣光形态，大家各自挑了对手：
捷克罗姆—帕路奇犽
莱希拉姆—帝牙卢卡
雷吉奇卡斯+三神柱—骑拉帝纳
洛奇亚+凤王—哲尔尼亚斯
拉帝欧斯+拉帝亚斯—伊裴尔塔尔
烈空坐+基格尔德—酋雷姆
梦幻+蒂安希+美洛耶塔+代欧奇希斯—达克莱伊
圣光忍蛙—邪恶忍蛙
剧场版，场面就是要大，可惜这是小说，不是动画，真希望能在动画中看到我脑海中的画面。这里的神兽过多，就不一一写战况了，一笔带过吧～
影子分身！
ko ga！
邪恶忍蛙来吧！
邪恶忍蛙飞了起来，俯冲向下击碎了一个又一个分身，圣光忍蛙跳了起来丢出手里剑被一个扫尾给弹开，圣光忍蛙结果自己的手里剑，邪恶忍蛙直接突脸，圣光忍蛙用手里剑阻挡，回击的刀刃被挡下，于是忍蛙一脚踢开拉开了距离。
圣光•回旋斩！
邪恶忍蛙五芒星•剑斩！
圣光忍蛙旋转起来，变成一个钻头冲向邪恶忍蛙，邪恶忍蛙分出四个分身，砍出的剑气变成一个五芒星，吃。冲击波炸飞了圣光忍蛙，反应过来后被突脸的邪恶忍蛙打飞坠到地上
邪恶忍蛙飞水手里剑！
暗袭要害！
掉在地上的忍蛙瞬移躲过了手里剑，突然出现在邪恶忍蛙的背后，竖直一道砍在邪恶忍蛙的背部，随即也被一发扫尾打在了腹部，两只宝可梦都掉落到了地上。
邪恶忍蛙我这具身体可是融合了喷火龙和烈焰猴，凭你的圣光可是不能击败我的……
在两只甲贺忍蛙激战的时候，身边的神兽幻兽在天冠山上混战，上来的楼梯早已被击毁，周边的树林也惨遭毁坏，混战过后两方打得两败俱伤（黑化强三倍，所以两败俱伤），小智身后昏厥着各神兽包括精疲力尽的N，邪恶忍蛙的背后也躺着被控制的神兽
小智，看来只能靠你了……
N正面打在了地上，但小智的身体根本无力去将他扶起，而且自己还要面对眼前的邪恶忍蛙……
邪恶忍蛙该了结一切了……
邪恶忍蛙拔刀斩！
邪恶忍蛙摆出拔刀的姿势，长时间的蓄力后挥出纯黑色的剑气。身体已经菠萝菠萝达的小智根本无力指挥甲贺忍蛙反击，但甲贺忍蛙靠着自己的意志站了起来，跑到小智跟前竖立手里剑抵挡剑气。
手里剑即将破碎，小智的身体像有了体力是的瞬间站了起来冲向甲贺忍蛙将它推到一边，与此同时，手里剑破碎剑气划过了小智的身体，小智直接正面到了下去……
在山下的众人看着紫墙上的“现场转播”人都傻了，根本不敢相信小智为了保护甲贺忍蛙直接接下了剑气，众人捶打着紫墙，歇斯底里的喊着小智的名字，但山上和山下隔着十万八千里，这点声音，还是没有传入小智的耳朵……
甲贺忍蛙爬在地上根本不敢相信自己的眼睛，一些醒过来的神兽反应了过来，强撑的身体走了过来
喂，小智！告诉我你没事的对吧！
小智，你出事了我怎么跟阿尔宙斯交代啊！
喂，小子，你帮我砍掉了卡洛斯地区的负能量树根，怎么就在这里倒下了啊！
我还没跟你好好的再旅行一次，我还答应了柚丽佳和瑟蕾娜要保护好你来这
当初对战三圣鸟的勇气没了吗！别在趴着了啊！
当初想和我对战的信心没了吗！我求你回应一下啊！以前你都会笑着说没事的啊
胡帕，还没和你旅行和你玩耍够你，你不能丢下胡帕啊！
众人企图唤醒受伤的小智，一旁的邪恶忍蛙也静静的看着这感人的一幕，另一边的甲贺忍蛙脑袋早已空白……小智的身体慢慢变成粒子，逐渐无法触摸，伴随着阵阵雨滴，小智消失在了天冠山山顶
邪恶忍蛙真是可怜，为了自己的宝可梦丢了性命……
你说什么！
我！要亲手干掉你！
邪恶忍蛙可惜你没有这个实力！
邪恶忍蛙挥手，黑暗触手直接缠住了众宝可梦使其动弹不得。圣光忍蛙冲了过去使用了圣剑咏叹，被邪恶忍蛙一下子躲避被一刀砍在腹部击飞了出去
邪恶忍蛙可惜，你很弱，无法给小智报仇呢……
邪恶忍蛙现在，该进行仪式了……
邪恶忍蛙转过身子，开始准备进行仪式
未知空间
我……这是死了吗……
小智飘浮在黑暗中，并不清楚自己在哪，突然出现的众人让他摸不着头脑
哟！
好久不见了！
为了找到你可废了我们好大一番功夫呢
小智，让你久等啦~
好了，现在不是闲聊的时候，该进入正题了
对啊？我这是在哪？
能为了自己的宝可梦而挡下致命一击，不愧是你啊。
现在这个时空是阿尔宙斯创造的，我们不能在这个空间里久留，想回去就得通过考验
考验？
就是三圣菇的考验
